A la fois muséum d'histoire naturelle et jardin zoologique sis au cœur de la citadelle de Besançon, le Zoo de la Citadelle présente des espèces d'animaux sauvages du monde dont un grand nombre sont menacées d'extinction et font l'objet de programmes d'élevages européens auxquels participe le muséum (singes, lémuriens, mammifères herbivores, oiseaux...) ainsi qu'un insectarium, un aquarium, une mini-ferme et un noctarium pour découvrir des espèces d'animaux nocturnes.
